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大家都說 RNA-seq 好,究竟好在哪裡??

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過去十幾年做基因表現與調控網路的專家們都使用過微陣列 (Microarray) 平台作為研究工具,而在次世代定序技術出現後,想必一定常聽到要做基因表現分析應該要用RNA-seq來進行會比較好 
,那你一定會問小編,究竟哪裡好?總得給我個交待、給我個滿意的理由吧!!


那小編就來為大家比較一下 RNA-seq 
 Microarray 摟~~豎起耳朵  要開始摟~ 


RNAseq_Array.png


(A) RNA-seq 不需預先知道基因序列,但 microarray 需預先知道基因序列

(B) RNA-seq 能偵測到所有的表現基因,即具有發現新基因的能力 (novel gene)

      Microarray 受限於探針 (probe) 設計,因此不具發現新基因的能力

(C) RNA-seq 偵測基因表現 (gene expression) 的靈敏度與解析度較 microarray 高

(D) RNA-seq 可同時偵測 SNP、InDel、Alternative splicing form

(E) RNA-seq 能偵測到『整個基因』的表現狀況,microarray 僅能就RNA與探針雜交之序列進行偵測

(F) 若RNA受到 miRNA 或其他後轉錄調控機制影響,RNA-seq 均能忠實反應

(G) 若基因在與探針配對處的序列發生變異,即便基因有表現,也會因序列沒法雜交 (hybridize) 而無法偵測到基因表現,但 RNA-seq 不受此變異影響,仍可正確偵測基因表現。


小編這樣的解釋,不知道大家滿意嗎?

不過研究就像科技一樣,想發高點數論文就要用最夯的技術。每次推出最新款的手機大家都會搶購嘗鮮,那進行研究當然要來一下NGS摟~您說是不是呢!!


圖爾思生物科技 / NGS事業部
郭育倫 文案
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