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體內微生物會影響你我的健康嗎?


微生物無處不在,無所不為。人體微生物組被稱為“人類第二基因組”,人類腸道內就有多達1000種的共生微生物。千萬不要小看微生物,我們須和它們和諧相處才能保證身體的健康。近年來研究者們還發現許多疾病都和微生物密切相關,下面說說幾項重要的研究成果吧。


肥胖關微生物甚麼事兒?

文章題目:Richness of human gutmicrobiome correlates with metabolic markers
發表期刊:Nature,2013
影響因子:42.351
材料選取:123位非肥胖和169位肥胖的丹麥人糞便樣本
測序策略:illumina測序平台,宏基因組測序,平均每個樣本68.2 million high-quality reads



研究結果:

1)肥胖和非肥胖樣本中腸道微生物基因和物種豐富度上有明顯差異,且其中已研究明確和未明確的細菌都存在差別,而豐富程度低的人肥胖程度、血脂異常和胰島素抗性都有所提高。

2)僅對少數幾種細菌標記進行分析,就可以區分細菌豐富程度的高低。


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圖1 豐富程度低(LGC)的人更容易肥胖



皮膚微生物那麼多!

文章題目:Biogeography and individuality shape function in the human skin metagenome
發表期刊:Nature,2014
影響因子:42.351
材料選取:15位健康人的各18處身體部位採樣
測序策略:illumina HiSeq測序平台,宏基因組測序,總共得到289G數據



圖2 皮膚中細菌、真菌和病毒的物種組成



MGCs在糖尿病人體內集結

文章題目:Gut metagenome in European women with normal, impaired and diabetic glucose control
發表期刊:Nature,2013
影響因子:41.456
材料選取:血糖正常的、不正常的以及正在進行血糖控制的70歲歐洲婦女的糞便樣本,共145例
測序策略:illumina HiSeq 2000測序平台,宏基因組測序,每個樣本3.1Gb的數據量


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圖3宏基因組簇數目和基因數目 (a)(b)MGCs中各分類水平所佔比例 (c) NGT and T2D人群中800個最大MGCs相對豐度




從口而入的結直腸癌MLG

文章題目:Gut microbiome development along the colorectal adenoma-carcinoma sequence
發表期刊:Nature Communications,2015
影響因子:10.742
材料選取:57例健康人、44例腺瘤病人和46例結直腸癌病人
測序策略:illumina HiSeq PE100測序平台,宏基因組測序,平均每個樣本5G的數據量


圖4 腺瘤病和結直腸癌樣本間的基因標記



參考文獻

[1] Le Chatelier E, Nielsen T, Qin J, et al . Richness of human gutmicrobiome correlates with metabolic markers. Nature. 2013, 500(7464), 541-546.

[2] Oh J, Byrd AL, Deming C, et al . Biogeography and individuality shape function in the human skin metagenome. Nature. 2014, 514(7520), 59-64.

[3] Karlsson FH, Tremaroli V, Nookaew I, et al . Gut metagenome in European women with normal, impaired and diabetic glucose control. Nature. 2013, 498(7452), 99-103.




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