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eHOMD人類口腔微生物資料庫

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人類口腔中存在大量微生物,其中大部分為人體共生微生物菌群,口腔微生物在出生過程中經由產道與母體接觸,以及出生後從外界經由飲食、吸菸、衛生習慣等產生變化,而這些口腔微生物菌相能夠改變局部及全身的健康與疾病之間的平衡,與人體免疫系統及口腔疾病息息相關,如齲齒、牙齦炎、牙周病、粘膜病(如扁平苔蘚、白斑)、口腔癌、植體周圍炎等,因此口腔微生物研究對人類健康有著舉足輕重的角色。
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目前有個專門收集人類口腔微生物資訊的資料庫:eHOMD (expanded Human Oral Microbiome Database; http://www.homd.org),eHOMD目前(v15.1)包括 770 種人類口腔微生物物種(687種來自於HOMD v.14.51),其中 57% 的物種具有明確命名,13% 的物種雖可培養但尚未被命名,30% 為未命名且不可培養的物種。針對暫未命名物種提供臨時命名方案,因此不同來源(不同實驗室、不同方法)的資料可以有穩定命名的參考方式。eHOMD的資訊來源於人類微生物體計畫 (HMP)與其他計畫中屬於呼吸消化道細菌的基因體資料。

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參考文獻
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Chen, T., Yu, W.-H., Izard, J., Baranova, O. V., Lakshmanan, A., & Dewhirst, F. E. (2010). The Human Oral Microbiome Database: a web accessible resource for investigating oral microbe taxonomic and genomic information. Database : the Journal of Biological Databases and Curation, 2010, baq013.

[2] Escapa, I. F., Chen, T., Huang, Y., Gajare, P., Dewhirst, F. E., & Lemon, K. P. (2018). New Insights into Human Nostril Microbiome from the Expanded Human Oral Microbiome Database (eHOMD): a Resource for the Microbiome of the Human Aerodigestive Tract. mSystems, 3(6), 8–20.


圖爾思生物科技 / 微生物體研究中心
郭育倫 文案

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