記事一覧

如何獲得高品質的RNA?

     原創文章     引用請註明出處 RNA的品質在後續的應用上扮演著決定性的角色,一般來說用來評斷RNA品質的好壞除了常聽到的260/280、260/230 ratio外,利用RNA integrity number (RIN)值來判斷RNA片段的完整性是另一個評定RNA品質較為重要的指標。但RNA相對來講較不穩定,也容易受到很多因素的影響而發生降解。因此,獲得高品質的RNA樣品變成是許多研究者努力的目標。在人體...

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10x Genomics 新知分享-單細胞定序平台在COVID-19研究上的相關應用

     原創文章     引用請註明出處[新知分享] 10x Genomics 單細胞定序平台在COVID-19研究上的相關應用自從2019年底爆發新冠肺炎病毒COVID-19全球的大流行之後,有非常多的專家學者與研究團隊紛紛投入疫苗的研製、藥物的製造與快篩試劑的研發。除此之外,也越來越多的學者將10x Genomics的單細胞定序的平台應用在這個全球矚目的議題上面,藉由此項技術的特性,此類的研究主要可...

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單細胞定序分析介紹 (六): 細胞標記 SingleR介紹

     原創文章     引用請註明出處 上一篇文章介紹了細胞標記可參考的資料庫,這邊小編要來詳細介紹SingleR[1] --- 自動化標記細胞的套件。SingleR內建參考資料數據,包含細胞對應的基因表現量表、每一顆細胞的 cell type 註解(一個 cell type 可能有多個重複)。注意,小編這裡介紹的是舊版本(v1.0.1),新版本已整合至bioconductor,方法及說明可能略有不同,若對新版本...

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