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發炎性腸道疾病(IBD)研究現況

消化系統疾病中有一種慢性復發型的發炎性腸道疾病(Inflammatory bowel disease,IBD),主要包括克隆氏症(Crohn's disease,CD)和潰瘍性結腸炎(Ulcerative colitis,UC)。根據調查顯示,IBD近年來在先進國家中的發病率逐年上升,其致病因素和發病機制尚未清楚了解,目前普遍認為是由於遺傳易感個體對腸道微生物的異常免疫反應所引起的腸道損傷。許多證據顯示,腸道菌群與IBD發病有高度相關。隨著高通量定序技術的發展,目前醫...

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三代定序在微生物研究的應用

這次就跟大家聊一聊新技術在微生物研究中的應用。細細想來,新技術的應用,怎麼能少得了它—全長擴增子定序。定序平台先介紹一下定序平台,目前應用較廣的技術是 PacbioRS II 和 Nanopore,Nanopore 利用新型納米孔技術,依據檢測DNA序列通過納米孔時電流的變化判斷鹼基資訊,但由於納米材料穩定性、電流幅度較小及DNA移位速率過快等問題,目前其應用的接受度沒有Pacbio RS II SMRT 定序高。擴增子是什麼?擴增子(amplicon)是指DN...

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糞便樣品處理與保存方式是否會影響微生物多樣性?

     原創文章     引用請註明出處在微生物多樣性研究中,樣品的處理與儲存條件對於分析微生物菌群有著重要的影響,尤其是進行人類腸道菌群研究時的樣品採集,由於往往無法採樣後立即進行人類糞便樣本的凍存處理或立即實驗分析,因此糞便樣品的保存方式及條件對於研究是相當重要的議題。對於處理與保存的時間與方法的探討,在今年有兩篇文章做了深入的討論,分別是:(A) 2016年...

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