【搬家公告】部落格停更公告
- 2022/04/11
- 13:59
【搬家/停更公告】我們搬新家囉！！感謝所有讀者的支持！為提升維護、提供更佳的閱讀環境與搜尋介面，即日起將停止更新文章於此網站。歡迎來大家來到新家參觀 點此進入新家更多二代定序、三代定序、多體學文章內容都在圖爾思官方網站喔！圖爾思十週年換新登入，歡迎參觀 ...
【2021年 --- PacBio的幾件重要事】
- 2022/03/10
- 15:01
原創文章 引用請註明出處上一篇文章跟大家分享了三代定序龍頭 Oxford Nanopore Technology (ONT) 在 2021 年的 21 件重要小事，怎麼可以錯過同為三代定序的龍頭 Pacific Bioscience (PacBio) 在 2021 年的進展呢？咱們輸人不輸陣，趕緊來看看在過去一年中，PacBio 發生了哪些重要事情吧！本文主要架構取材 PacBio 於去年11/8-11/9 舉辦的 PacBio Virtual User Meeting...
2021年 --- Nanopore 21件最重要的小事
- 2022/02/09
- 07:00
原創文章 引用請註明出處各位捧油~新年快樂!!過完了一個農曆年讓人真正感覺 2021 年已經離我們遠去，祝福大家 2022 年都能邁向更好的自己(●’◡’●)本篇譯自 Oxford Nanopore 官網 [1]，統整了 2021 年 Nanopore 本身技術或其使用者取得的關鍵進展，相信有些進展會讓你感到激勵人心、有些進展會讓你感到溫馨，一起花個幾分鐘看看過去的一年 Nanopore 21件最重要的小事吧!1. 至今最完整的人類基因體出爐先前的人類參考基因體...
【平台大亂鬥：比較二代與三代平台之間的再現性、準確性和實用性 (下)】
- 2022/01/26
- 07:00
原創文章 引用請註明出處在上個月的文章【平台大亂鬥：比較二代與三代平台之間的再現性、準確性和實用性 (上)】中，介紹不同平台之間定序人類基因體 RM8392 細胞株的結果，比較了數據品質、覆蓋率、錯誤配對率等指標性數值。在這篇文章中，將為大家介紹不同平台定序人類基因體後，分析單核苷酸變異、插入/缺失序列、結構變異以及定序細菌總基因體的結果[1]。同上篇，...
你。不只是你。總體基因體學揭開人體內宇宙 (下)
- 2022/01/12
- 07:00
原創文章 引用請註明出處各位，元旦快樂 ~接下來就讓我們期待過年的 9 天連假吧!! (超認真的真心話) 繼續 (下) 篇的內容吧! (下) 篇的內容包含 Nanopore 定序平台的介紹、不同應用需要的數據量建議、Nanopore 提供之總體基因體學研究相關分析軟體以及案例分享，內容豐富請盡早服用，避免向隅喔~前情提要在這裡--你。不只是你。總體基因體學揭開人體內宇宙 (上)對於許多總體基因體學應用，從檢測到分析結果的總花費時間是...
【RNAseq 3小學堂】RNAseq多的是，你不知道的事
- 2021/12/31
- 09:00
原創文章 引用請註明出處#RNAseq #實驗設計 #雲平台 #3小學堂|| 3分鐘速解RNAseq分析，本周RNAseq多的是，你不知道的事 ||看完了一系列的 RNAseq 3小學堂，相信你對 RNAseq 分析結果和報告內容有了進一步的認識，你是不是躍躍欲試了呢！小編在這裡整理了幾個在過去的經驗中，一些可能會被忽略的部分，強烈建議在開始實驗之前先瀏覽本篇文章喔~ || 條件允許的話，...
【平台大亂鬥：比較二代與三代平台之間的再現性、準確性和實用性 (上)】
- 2021/12/24
- 15:19
原創文章 引用請註明出處隨著定序成本的降低，高通量DNA定序技術在臨床檢測與基礎生醫研究中已被視為常用方法，其用途包含但不限於個體或族群間的變異偵測、基因體物種等級的鑑定，辨識混合物中的物種多樣性等[1,2]。DNA定序可能會因各種因素影響上機結果，包含樣品收集、建庫的準備、定序機型及試劑，以及後續的生物資訊分析手法，以上各項都會影響DNA定序的準確性及...
【RNAseq 3小學堂】樣本間相關性分析
- 2021/12/24
- 09:00
原創文章 引用請註明出處#RNAseq #QC #雲平台 #3小學堂|| 3分鐘速解RNAseq分析，本周介紹樣本間相關性分析 ||有無生物性重複在分析呈現上，除了 DEG分析 用的方法不同之外，還有什麼不同的地方呢?|| 生物性重複做的越好，對實驗的穩定性和可靠程度是大大的加分 ||具有生物性重複的實驗樣本，除了能檢定實驗在操作上的穩定性，更重要的是能夠檢定差異表現量的基因是否...
【RNAseq 3小學堂】RNAseq 序列品質控管
- 2021/12/17
- 09:00
原創文章 引用請註明出處#RNAseq #QC #3小學堂|| 3分鐘速解RNAseq分析，本周介紹RNAseq序列品質控管 ||相信大家都聽過 Garbage in, garbage out 這句話，要有好的分析報告首要就是要有好的數據，那在 RNAseq 分析之前會做那些分析確認序列品質，就讓小編來一一介紹囉~！|| 不要盡信 Fastqc 結果！要考慮 library 類型！ || NGS 數據下機之後，首要當然是進行 fas...
【RNAseq 3小學堂】Read Count 標準化方法
- 2021/12/10
- 09:00
原創文章 引用請註明出處#RNAseq #標準化 #雲平台 #3小學堂|| 3分鐘速解RNAseq分析，本周介紹Read count 標準化方法 ||小編偷偷問一個問題喔~ 你知道圖爾思 RNAseq 報告有3種標準化的表格，分別是： FPKM、TPM、RLE/TMM 。看到這，是不是被這群不知是誰的標準化方法搞混了呢？又為什麼RLE後面還有接一個TMM呢？直覺的想，定序結果比對參考基因體之後，就可以知道每個...
你。不只是你。總體基因體學揭開人體內宇宙 (上)
- 2021/12/08
- 11:10
原創文章 引用請註明出處『我不怕，就算殺了一個我，還有千千萬萬個我。』～出自「功夫」的…理髮師。今天小編就從科學上來跟你說其實這句話一點也不誇飾，甚至還含蓄了些。你。不只是你。如果說人體就是一個宇宙的話，這個宇宙的成員是細胞和各種各樣的細菌，數量甚至遠遠大於銀河系的恆星。即使是在你很乾淨也很健康的狀態時，你的皮膚上每時每刻也有一萬億個細菌在覓食。算算比例，人體大約由一億億個細胞組成，還有10...
